Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd1P40201 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd1P40201 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd1P40201 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd1P40201 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd1P40201 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd1P40201 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms