Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms