Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik2P39087 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms