Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprkP35822 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprkP35822 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms