Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab20P35295 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms