Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn11P35235 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn11P35235 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms