Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc11P31313 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms