Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa2P31245 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms