Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnd1P30999 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms