Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprmP28828 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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