Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kif5cP28738 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms