Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Marcksl1P28667 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms