Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hoxd10P28359 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hoxd10P28359 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hoxd10P28359 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Hoxd10P28359 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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