Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms