Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vav1P27870 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vav1P27870 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vav1P27870 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms