Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms