Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdk11bP24788 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk11bP24788 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms