Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Ggta1P23336 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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