Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tpm3P21107 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms