Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SagP20443 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SagP20443 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SagP20443 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SagP20443 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms