Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms