Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Selenbp1P17563 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms