Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmnb1P14733 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms