Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms