Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chrm1P12657 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chrm1P12657 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms