Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt8P11679 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Krt8P11679 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt8P11679 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms