Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa1P11477 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms