Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp1P11438 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp1P11438 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms