Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms