Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd4P10628 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms