Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms