Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04213 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04213 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04213 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04213 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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