Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01673 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01673 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01673 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01673 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01673 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01673 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01673 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01673 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01673 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01673 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01673 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01673 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01673 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01673 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01673 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms