Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01672 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01672 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01672 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01672 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01672 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms