Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BlmO88700 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BlmO88700 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BlmO88700 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms