Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ComtO88587 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ComtO88587 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ComtO88587 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ComtO88587 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ComtO88587 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ComtO88587 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ComtO88587 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ComtO88587 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ComtO88587 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ComtO88587 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ComtO88587 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ComtO88587 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ComtO88587 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ComtO88587 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ComtO88587 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ComtO88587 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ComtO88587 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms