Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3aO88508 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3aO88508 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms