Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klc1O88447 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klc1O88447 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms