Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cfdp1O88271 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms