Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stra6O70491 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Stra6O70491 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Stra6O70491 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Stra6O70491 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Stra6O70491 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stra6O70491 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Stra6O70491 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stra6O70491 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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