Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms