Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms