Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Copb2O55029 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms