Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SlkO54988 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SlkO54988 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SlkO54988 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms