Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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DffaO54786 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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DffaO54786 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DffaO54786 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms