Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CrxO54751 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CrxO54751 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms