Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gp1baO35930 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms