Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cops5O35864 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops5O35864 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops5O35864 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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