Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf9O35739 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf9O35739 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms