Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clk3O35492 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk3O35492 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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